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De acuerdo a las Estadísticas del Agua en México, Edición 2005, elaboradas por la Comisión Nacional del Agua, una región hidrológica se puede definir como:
«Área territorial conformada en función de sus características orográficas e hidrológicas, con el fin de agrupar la información hidrológica y de calidad del agua. Los límites regionales no coinciden con los estatales ni los municipales.»
Para la realización de estudios hidrológicos y de la calidad del agua, se divide la República Mexicana en 37 Regiones Hidrológicas.
INEGI. Conjunto de Datos Geográficos de la Carta Hidrológica de Aguas Superficiales, 1:250,000
CEA Jalisco. SIAEJ. Sistema de Información del Agua
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El Estado de Jalisco contiene 7 Regiones Hidrológicas.
INEGI. Conjunto de Datos Geográficos de la Carta Hidrológica de Aguas Superficiales, 1:250,000
CEA Jalisco. SIAEJ. Sistema de Información del Agua
| Armería–Coahuayana | Lerma–Santiago |
| Balsas | Río Ameca |
| Costa de Jalisco | Río Huicicila |
| El Salado |
Las siete Regiones Hidrológicas que hay en el Estado de Jalisco están divididas en varias sub-regiones.
INEGI. Conjunto de Datos Geográficos de la Carta Hidrológica de Aguas Superficiales, 1:250,000
CEA Jalisco. SIAEJ. Sistema de Información del Agua
| Alto Santiago | Bajo Santiago | El Salado |
| Ameca | Balsas | Huicicila |
| Armería | Coahuayana | Medio Lerma |
| Bajo Lerma | Costa de Jalisco | Tepalcatepec |
En el Estado de Jalisco hay 20 Cuencas Hidrológicas.
INEGI. Conjunto de Datos Geográficos de la Carta Hidrológica de Aguas Superficiales, 1:250,000
INEGI. Anuario Estadístico del Estado de Jalisco. 20005.
CEA Jalisco. SIAEJ. Sistema de Información del Agua
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Para fines administrativos, la CONAGUA divide el país en 13 Regiones Hidrológico–Administrativas, que toman en cuenta los límites de los municipios. Como se define en las Estadísticas del Agua en México, Edición 2005:
«Área territorial definida de acuerdo a criterios hidrológicos en la que se considera a la cuenca como la unidad básica más apropiada para el manejo del agua y al municipio como la Unidad mínima administrativa del país.
La República Mexicana se ha dividido en 13 regiones administrativas. A las regiones administrativas también se les conoce como regiones hidrológico–administrativas.»
INEGI. Conjunto de Datos Geográficos de la Carta Hidrológica de Aguas Superficiales, 1:250,000
CEA Jalisco. SIAEJ. Sistema de Información del Agua
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Para la administración y gestión del Agua en las diferentes cuencas, existen los Consejos de cuenca, que están comprendidos por varios grupos de trabajo. El Estado de Jalisco tiene particiación en los siquientes consejos:
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